Ricerca di conformazioni di minima energia potenziale intramolecolare mediante un nuovo metodo di minimizzazione globale.
Tosi, Camillo ; Pavani, Raffaella ; Fusco, Roberto ; Aluffi-Pentini, Filippo ; Parisi, Valerio ; Zirilli, Francesco
Atti della Accademia Nazionale dei Lincei. Classe di Scienze Fisiche, Matematiche e Naturali. Rendiconti, Tome 78 (1985), p. 149-156 / Harvested from Biblioteca Digitale Italiana di Matematica
Access to full text
Full (PDF)
Full (DjVu)

A recent method for the global optimization of a real valued function defined in the n-dimensional euclidean space has been applied to the detection of the most stable conformation of a molecule. The method, inspired by the quantum mechanical theory of diffusion across potential barriers, finds the deepest minimum of the intramolecular energy hypersurface by following the asymptotic behaviour of the paths of a system of stochastic differential equations. As an example of its application, the search for the global minimum of the deoxyribose-phosphate-deoxyribose fragment (regarded as the smallest unit representative of polynucleotide backbones) is described.

Publié le : 1985-04-01
@article{RLINA_1985_8_78_4_149_0,
     author = {Camillo Tosi and Raffaella Pavani and Roberto Fusco and Filippo Aluffi-Pentini and Valerio Parisi and Francesco Zirilli},
     title = { Ricerca di conformazioni di minima energia potenziale intramolecolare mediante un nuovo metodo di minimizzazione globale.},
     journal = {Atti della Accademia Nazionale dei Lincei. Classe di Scienze Fisiche, Matematiche e Naturali. Rendiconti},
     volume = {78},
     year = {1985},
     pages = {149-156},
     language = {it},
     url = {http://dml.mathdoc.fr/item/RLINA_1985_8_78_4_149_0}
}

Tosi, Camillo; Pavani, Raffaella; Fusco, Roberto; Aluffi-Pentini, Filippo; Parisi, Valerio; Zirilli, Francesco.  Ricerca di conformazioni di minima energia potenziale intramolecolare mediante un nuovo metodo di minimizzazione globale.. Atti della Accademia Nazionale dei Lincei. Classe di Scienze Fisiche, Matematiche e Naturali. Rendiconti, Tome 78 (1985) pp. 149-156. http://gdmltest.u-ga.fr/item/RLINA_1985_8_78_4_149_0/

[1] Aluffi-Pentini, F., Parisi, V., e Zirilli, F. - Global optimization and stochastic differential equations. «Journal of Optimization Theory and Applications», 47/1 (September 1985), pp. 1-16. | MR 802386 | Zbl 0549.65038

[2] Aluffi-Pentini, F., Parisi, V., e Zirilli, F. - A global optimization algorithm using stochastic differential equations, Technical Summary Report n. 2791, Mathematics Research Center, University of Wisconsin - Madison, Febr. 1985; inviato per la pubblicazione a ACM Transactions on Mathematical Software. | Zbl 0665.65061

[3] Aluffi-Pentini, F., Parisi, V., e Zirilli, F. - Algorithm SIGMA. A stochastic-integration global minimization algorithm. Technical Summary Report n. 2806 Mathematics Research Center, University of Wisconsin - Madison, March 1985; inviato per la pubblicazione a ACM Transactions on Mathematical Software. | Zbl 0709.65519

[4] Matsuoka, O., Tosi, C. e Clementi, E. (1978) - «Biopolymers», 17, 33.

[5] Tosi, C., Clementi, E. e Matsuoka, O. (1978) - «Biopolymers», 17, 51.

[6] Sundaralingam, M. e Jensen, L.H. (1965) - «J. Mol. Biol.», 13, 914.

[7] Tosi, C. e Rasmussen (1981) - «Biopolymers», 20, 1059.

[8] Tosi, C. e Pescatori, E. (1978) - «Gazz. Chim. Ital.», 108, 365.