Viene presentato un nuovo approccio allo studio di sequenze nucleotidiche basato su calcoli di serie Fourier. La sequenza nucleotidica di un gene, rappresentabile mediante i simboli delle quattro basi viene risolta in quattro sequenze «omonucleotidiche» che vengono considerate ciascuna come un reticolo lineare caratterizzato dalla ripetizione di una base e di «vacanze» (X) corrispondenti alle tre rimanenti basi. Viene calcolata la Trasformata di Fourier (F.T.). Successivamente vengono calcolate delle serie di Fourier aventi come coefficienti i quadrati dei valori assoluti della Trasformata di Fourier. Si ottiene così una funzione del tutto analoga alla «funzione Patterson», largamente impiegata nell’analisi strutturale dei cristalli. I massimi della funzione corrispondono a vettori i cui moduli rappresentano distanze fra basi identiche nella sequenza nucleotidica del gene. Questa funzione viene mostrata per il gene della globina dell'Aplisia. La funzione contiene picchi corrispondenti a distanze di 3 unità e multiple di 3 (3, 6, 12, 15,...).
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author = {Alfonso M. Liquori and Stefano Ottani and Alberto Ripamonti and Claudia Sadun},
title = {Genes as quasi-periodic linear lattices: a novel approach to the analysis of nucleotide sequences},
journal = {Atti della Accademia Nazionale dei Lincei. Classe di Scienze Fisiche, Matematiche e Naturali. Rendiconti},
volume = {74},
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Liquori, Alfonso M.; Ottani, Stefano; Ripamonti, Alberto; Sadun, Claudia. Genes as quasi-periodic linear lattices: a novel approach to the analysis of nucleotide sequences. Atti della Accademia Nazionale dei Lincei. Classe di Scienze Fisiche, Matematiche e Naturali. Rendiconti, Tome 74 (1983) pp. 389-395. http://gdmltest.u-ga.fr/item/RLINA_1983_8_74_6_389_0/
[1] , , , , and (1983) - «Molecular Biology of the Cell», ed. Garland Publishing Inc. New York.
[2] (1981) - «J. Mol. Evol.», 17, 94.
[3] and (1981) - «Oswatish Die Naturwissenschaften», 68, 217.
[4] (1960) - La diffrazione dei raggi X nello studio della costituzione molecolare di sostanze naturali. Varenna 1958 - Ed. Accad. Naz. Lincei.
[5] , and (1970) - «Computing», 6, 121.