L'objet de ce travail est de développer une théorie abstraite des systèmes de racines de façon suffisamment générale pour englober les systèmes des algèbres de kac-Moody, ceux de leurs généralisations par borcherds ainsi que ceux des formes presque déployées des algèbres de kac-Moody. Le cadre abstrait choisi permet d'obtenir trois théorèmes de stabilité importants: passage aux sous-systèmes, quotient par un groupe d'automorphismes de diagramme, quotient par une partie de type fini. (Ces quotients apparaissent dans l'étude des systèmes de racines des formes presque déployées). Enfin un résultat de conjugaison des bases est démontré dans le cas indécomposable.